Genoma de berro sal produce nuevas pistas para tolerancia de sal

13 De julio de 2012, Shenzhen, China – un equipo internacional, liderado por el Instituto de genética y biología del desarrollo, la Academia China de Ciencias y BGI, organización de genómica más grande del mundo, ha completado la secuencia genómica y análisis de sal berro (Thellungiella salsuginea), una planta silvestre tolerantes a la sal. El genoma de sal Berro sirve como una herramienta útil para explorar mecanismos de evolución adaptativa y arroja nuevas luces en la comprensión de las características genéticas subyacentes planta tolerancia al estrés abiótico. El estudio fue publicado en Internet en PNAS. (http://www.pnas.org/content/early/2012/07/05/1209954109.abstract?sid=548ade97-58d5-4c0a-a1e4-e1a43a9c9c21).

Sal Berro es un típico halófitas con alta resistencia al frío, la sequía, el estrés oxidativos y la salinidad. Debido a su tamaño de planta pequeña, corto ciclo de vida, producción de semilla abundante, tamaño pequeño genoma y una transformación eficiente, berro sal podría servir como un sistema de modelo genético importante botánico, genetistas y mejoradores explorar mejor los mecanismos genéticos de la tolerancia al estrés abiótico.

En el estudio, los investigadores secuenciaron el genoma de sal berro (ecotipo de Shandong) utilizando la tecnología de secuenciación de Solexa final emparejado. Los datos genómicos produjeron una secuencia de proyecto de sal Berro con cobertura sobre 134-fold. La longitud final de las secuencias ensambladas ascendieron a unos 233.7 Mb, cubriendo aproximadamente el 90% del tamaño estimado (~ 260 Mb). Un total de regiones de codificación de la proteína 28.457 predijo en el genoma secuenciado Berro sal. Los investigadores encontraron que la longitud del exón promedio de sal Berro y genes de a. thaliana fue similar, mientras que la longitud del intrón promedio de sal Berro fue aproximadamente un 30% mayor que la de a. thaliana.

El análisis evolutivo indicó que Berro sal y su pariente cercano-Arabidopsis thaliana – divergieron desde hace años de aproximadamente 7 – 12million. Al rastrear las diferencias entre sal Berro y a. thaliana, los investigadores encontraron sal Berro se caracterizó por un estilo de vida radicalmente diferente, un complemento único gen, diferencias significativas en la expresión de orthologs y el tamaño del genoma. Notablemente, el genoma de berro sal mostró contenido de elementos transponibles (TEs) considerablemente mayor que la de a. thaliana, que puede ser la razón de su tamaño genoma ampliada. Al igual que otras plantas superiores, berro sal genoma fue consistió en abundancia de retrotransposones long terminal repeat (LTR).

Sal puede tener efectos drásticos en el crecimiento y el rendimiento de cultivos agronómicos. Se estima que la salinidad representa aproximadamente un tercio de las tierras de regadío del mundo no aptos para la producción de cultivos. En este estudio, los investigadores identificaron varios genes en sal Berro que contribuyen a su éxito en ambientes de sal, como los genes relacionados con el transporte de cationes, señalización de ácido abscísico y la producción de cera.

JuNyI Wang, Director de Ciencias & tecnología, investigación & centro de cooperación, BGI, dijo, “sal Berro proporciona un excelente modelo y oportunidad para los investigadores a estudiar los mecanismos de la planta de tolerancia al estrés abiótico. La secuencia genómica completa de berro sal será impulsar el avance de la investigación de tolerancia del estrés así como proporcionar un valioso teórico instruir y soporte técnico para investigadores en todo el mundo para enfrentar mejor los desafíos de la salinización del suelo en el área de riego, el desarrollo y la utilización de aguas marinas someras y playas y la seguridad alimentaria.”

Peliculas Online